Etter kommuneloven er rådmannen øverste leder for kommunens administrasjon innenfor de rammer som kommunestyret fastsetter. Administrasjonen i kommunen er organisert med rådmannen som øverste leder for sju etater med hver sin virksomhetsleder, i tillegg til tre sentrale stabsfunksjoner.
Rødøy kommune har en sektororganisert ledelse, som bygger på funksjonelle og identifiserbare enheter. Strukturen har vært omlag den samme siden midten av 1980-åra.